在創業板申請首次公開發行股票而未通過的企業共涉及持續盈利能力問題、規范運作問題、財務會計問題、獨立性問題、主體資格問題、募集資金運用問題和信息披露問題這7大問題。
“創業板審核一直在加速。”深圳某券商一位保薦代表人告訴本報記者，“在加速的同時，企業的新問題開始浮現，PE腐敗更是被頻頻強調。”所謂的PE腐敗是指一些號稱但并非真正PE的投資人士通過各種關系拿到上市前股權的投資機會。這些人可能知道證監會開始要審核項目，或知曉上市的時間表，然后通過各種關系以及各種運作拿到這些上市公司的投資額度，然后把額度加價賣給別人，或者自己持有。
另一問題是創業板企業的利潤問題。“在早幾批的優秀項目上市之后，如今的創業板項目企業利潤明顯偏低，在這之中，可能會出現企業調控近三年利潤的手段出現。”一位保薦代表人分析。
涉及公司共17家，如深圳市方直科技股份有限公司、杭州正方軟件股份有限公司、北京侏羅紀軟件股份有限公司、杭州先臨三維科技股份有限公司。
具體表現為：1,成長性欠缺。如上海奇想青晨化工科技股份有限公司最近3年實現凈利潤分別是2050萬元、2402萬元和2600萬元，對應的同比增幅僅為17%、8%，企業2008年營業利潤比2007年下降21.14%，營收也僅增長3.16%，且產品售價也呈現逐年下降之勢。2,公司規模不足。如深圳市方直科技股份有限公司雖然最近3年成長速度較快，贏利能力大幅增強，但公司規模仍然較小，2009年底，總資產5904.58萬元，股東權益5278.63萬元。3,行業前景或經營環境發生重大變化。4,企業不符合創業板定位。如廣東廣機是一家招標采購服務商，一家沒有任何核心技術且所處行業競爭高度激烈的公司。
擬上市公司主體是否獨立、股權是否穩定、治理是否達標也是重要的考察內容。下面這些公司被否大多與上述原因有關：安得物流對美的集團存在大量關聯交易，其高管也多由美的集團選派；從事保健品業務的航天生物需要借助控股股東的研發平臺實現核心研發工作，主要研發人員也由后者研究人員兼職；同濟同捷存在股權結構問題；三英焊業發行前實際控制人發生變化；銀泰科技因和控股股東存在大量財務往來，被認為資金管理存在缺陷。
保薦機構應重點推薦符合國家戰略性新興產業發展方向的企業，特別是新能源、新材料、信息、生物與新醫藥、節能環保、航空航天、海洋、先進制造、高技術服務等領域的企業，以及其他領域中具有自主創新能力、成長性強的企業。
保薦機構推薦下列領域的企業，應當就該企業是否符合創業板定位履行嚴格的核查論證程序，并在發行保薦書和保薦工作報告中說明論證過程和論證結論，尤其應當重點論述企業在技術和業務模式方面是否具有突出的自主創新能力，是否有利于促進產業結構調整和技術升級：(一)紡織、服裝;(二)電力、煤氣及水的生產供應等公用事業;(三)房地產開發與經營，土木工程建筑;(四)交通運輸;(五)酒類、食品、飲料;(六)金融;(七)一般性服務業;(八)國家產業政策明確抑制的產能過剩和重復建設的行業。
保薦機構選擇、推薦創業板企業，應當重點關注企業的創新能力，深入核查企業是否擁有關鍵的核心技術、突出的研發優勢、創新的業務模式以及較強的市場開拓能力，并在成長性專項意見中予以說明。[詳情]
如深圳市方直科技股份有限公司、杭州正方軟件股份有限公司、北京侏羅紀軟件股份有限公司、杭州先臨三維科技股份有限公司
如北京福星曉程電子科技股份有限公司、江西恒大高新技術股份有限公司、北京易訊無限信息技術股份有限公司、上海金仕達衛寧軟件股份有限公司
如南京磐能電力科技股份有限公司、上海同濟同捷科技股份有限公司、江西恒大高新技術股份有限公司、天津三英焊業股份有限公司
如安徽桑樂金股份有限公司、武漢銀泰科技電源股份有限公司、深圳海聯訊科技股份有限公司、上海麥杰科技股份有限公司
如深圳市卓寶科技股份有限公司、上海開能環保設備股份有限公司、蘇州恒久光電、廣東廣機國際招標股份有限公司
如上海奇想青晨化工科技股份有限公司、賽輪股份有限公司、北京博暉創新光電技術股份有限公司、廣東冠昊生物科技股份有限公司