《自然》顛覆性發(fā)現(xiàn):所有生命,都是甲烷生產(chǎn)者

《自然》顛覆性發(fā)現(xiàn):所有生命,都是甲烷生產(chǎn)者
2022年03月14日 11:40 新浪科技綜合

  ▎藥明康德內(nèi)容團(tuán)隊(duì)編輯

  作為結(jié)構(gòu)最簡單的有機(jī)物,甲烷也是一種強(qiáng)效溫室氣體——其溫室效應(yīng)是二氧化碳的20多倍。而在向大氣釋放的甲烷中,有70%都是生物來源??茖W(xué)家早已揭示了這些甲烷的來源:一類古菌可以在缺氧環(huán)境中,在酶的參與下利用二氧化碳、氫氣等簡單反應(yīng)物產(chǎn)生甲烷。

  進(jìn)入21世紀(jì)后,人們逐漸意識(shí)到,生物成因的甲烷形成過程遠(yuǎn)比這個(gè)故事復(fù)雜。能產(chǎn)生甲烷的不止是那些產(chǎn)甲烷古菌,反應(yīng)條件也不限于缺氧環(huán)境。從藻類、藍(lán)細(xì)菌到多細(xì)胞的真菌、植物,越來越多的證據(jù)表明,多種需氧生物都能產(chǎn)生甲烷。但這些生物究竟是如何產(chǎn)甲烷的,卻始終是個(gè)未知數(shù)。

  在本周《自然》雜志的一項(xiàng)最新研究中,由德國海德堡大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)提出了一個(gè)顛覆性的觀點(diǎn):包括人類在內(nèi),所有生物都是甲烷的生產(chǎn)者。這個(gè)結(jié)論不僅讓我們重新認(rèn)識(shí)甲烷在生命過程中的作用,還將為多個(gè)領(lǐng)域帶來全新見解。

  早在8年前,這支團(tuán)隊(duì)就在一篇《自然·通訊》論文中,描述了一個(gè)通過非生物途徑三步生成甲烷的過程。簡單地說,這個(gè)反應(yīng)不需要酶參與,且主要原料只有3類:活性氧簇(ROS)、自由鐵以及合適的甲基供體。

  整個(gè)反應(yīng)過程也不復(fù)雜:首先,ROS(該反應(yīng)使用的是過氧化氫)和二價(jià)鐵離子反應(yīng),產(chǎn)生高度還原的羥基自由基(·OH);隨后,羥基自由基與甲基供體反應(yīng),形成甲基自由基(·CH3);最后,甲基自由基和氫自由基(·H)結(jié)合,產(chǎn)生甲烷分子。

  在實(shí)驗(yàn)室中揭示了這個(gè)甲烷生成過程之后,研究團(tuán)隊(duì)產(chǎn)生了一個(gè)大膽而有趣的想法。在生命體內(nèi)中,這些原料并不罕見(例如,細(xì)胞中也在持續(xù)產(chǎn)生、釋放包括過氧化氫在內(nèi)的ROS,而自由鐵和甲基供體也是常見的代謝產(chǎn)物),并且細(xì)胞環(huán)境也與上述實(shí)驗(yàn)室反應(yīng)條件相近。那么,這個(gè)產(chǎn)甲烷的過程同樣可以在生物體內(nèi)發(fā)生嗎?

  在最新研究中,研究團(tuán)隊(duì)首先利用枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)來檢驗(yàn)這個(gè)猜想。這種細(xì)菌的生命周期包含了兩種狀態(tài):休眠期和生殖生長期,因此可以用作對(duì)照,研究新陳代謝過程能否生成甲烷。

  實(shí)驗(yàn)結(jié)果十分清晰:在含有甲基供體二甲基亞砜(DMSO)的培養(yǎng)基中,不需要任何酶的參與,處于生殖生長期、代謝旺盛的枯草芽孢桿菌能持續(xù)生成甲烷,而休眠期的細(xì)菌則不會(huì)生產(chǎn)甲烷。

  隨后的控制變量實(shí)驗(yàn)顯示,這些細(xì)菌可獲取的甲基供體、自由體的含量,對(duì)于最終的甲烷產(chǎn)量也起到了明顯的調(diào)控作用。尤其值得注意的是,除了更強(qiáng)的新陳代謝,出現(xiàn)氧化應(yīng)激時(shí),即ROS過剩導(dǎo)致細(xì)胞無法維持氧化還原平衡,細(xì)菌的甲烷產(chǎn)量也隨之上漲。

  進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證實(shí),能通過這個(gè)過程產(chǎn)生甲烷的不僅有枯草芽孢桿菌。從之前被認(rèn)為不產(chǎn)甲烷的其他古菌,到酵母、黏菌等真菌;從代表植物界的葡萄,再到人源的細(xì)胞系(人胚腎細(xì)胞),都能在DMSO的培養(yǎng)基中生成甲烷,并且在氧化應(yīng)激條件下甲烷產(chǎn)量更高。因此研究認(rèn)為,或許所有進(jìn)行新陳代謝的生命體,都能通過這個(gè)普適的過程,在細(xì)胞內(nèi)持續(xù)產(chǎn)生甲烷。

  如果這個(gè)猜想最終得到證實(shí),那么一系列生命活動(dòng)都有望得到新的解釋。在生物體內(nèi),新陳代謝產(chǎn)生的ROS大量堆積時(shí),可能對(duì)DNA、RNA和蛋白質(zhì)等重要分子造成損傷。而這個(gè)新發(fā)現(xiàn)的過程,或許是消除過量ROS的一種途徑。

  論文通訊作者之一,海德堡大學(xué)的Frank Keppler教授表示:“我們的發(fā)現(xiàn)將成為理解需氧甲烷生成的里程碑,這個(gè)通用機(jī)制還將解釋之前在植物身上觀察到的現(xiàn)象。”

  值得注意的是,在之前的研究中,即使是對(duì)于同一種生物,不同個(gè)體的甲烷產(chǎn)量也可能有幾個(gè)數(shù)量級(jí)的差異。而最新研究揭示的機(jī)制,或許能解釋這個(gè)現(xiàn)象——那些極高的甲烷產(chǎn)量,可能是因?yàn)閭€(gè)體正進(jìn)行著活躍的代謝活動(dòng)。

  可以說,這個(gè)令人意外的發(fā)現(xiàn)在廣闊的領(lǐng)域都具有重大意義。醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,細(xì)胞中和通過組織擴(kuò)散的過量甲烷可以指示細(xì)胞壓力、氧化還原不平衡等?!昂粑屑淄榈牟▌?dòng)能反映氧化應(yīng)激程度,或是指向免疫系統(tǒng)。” Keppler教授說。而在氣候領(lǐng)域,通過這個(gè)過程產(chǎn)生的甲烷是否會(huì)對(duì)全球氣候產(chǎn)生影響,同樣尚不清晰。但對(duì)我們來說,足夠清晰的是,這個(gè)關(guān)于常見氣體的發(fā)現(xiàn)將為我們理解自身以及整個(gè)世界,打開一扇全新的窗口。

  封面圖來源:123RF

  參考資料:

  [1] Ernst, L。, Steinfeld, B。, Barayeu, U。 et al。 Methane formation driven by reactive oxygen species across all living organisms。 Nature (2022)。 https://doi.org/10.1038/s41586-022-04511-9

  [2] Methane might be made by all living organisms。 Retrieved Mar。 9, 2022 from https://www.nature.com/articles/d41586-022-00206-3

  [3] Althoff, F。, Benzing, K。, Comba, P。 et al。 Abiotic methanogenesis from organosulphur compounds under ambient conditions。 Nat Commun (2014)。 https://doi.org/10.1038/ncomms5205

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