2006年，我國醫藥生產企業實現銷售收入5200億元，同比增長17.53%，與2005年相比，增幅下降了8個百分點；利潤為400億元，同比僅增長11.01%，而去年同期全國工業平均利潤增長達31%，與2005年23%的增幅相比，下降了12個百分點。此外，我國醫藥各子行業的利潤水平普遍偏低，利潤率最高的生物制藥也只有10.58%，化學原料藥利潤率為5.27%，化學制劑為8.32%，中成藥為9.14%，中藥飲片為5.45%。