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在環(huán)保投入方面，國家的總體要求是，政府投入的比例，要保持在GDP的1.5%—2%之間。實際上，在整個“十五”期間，內蒙政府的投入，并未達到這個比例。
根據內蒙“十一五”規(guī)劃，在未來五年中，內蒙將加大政府投入。
內蒙財政廳的官員向記者表示，可能采取的措施是，在財政支出項目上，各級政府
將建立環(huán)境保護專項，并落實環(huán)保機構人員工資及其工作經費。
“按照誰開發(fā)、誰保護，誰投資、誰受益的原則，建立健全環(huán)境保護財政政策機制。完善財稅政策，支持循環(huán)經濟發(fā)展。在政府采購時，優(yōu)先采購環(huán)保、節(jié)能產品。”
特別值得一提的是，其“十一五”環(huán)保規(guī)劃指出，在環(huán)境管理、執(zhí)法監(jiān)察、監(jiān)測、宣教、信息、科研等方面，其經費要給予重點保障。
在污染防治專項資金中，將安排一定比例用于環(huán)境監(jiān)管能力建設。同時，積極利用國外貸款，支持新牧區(qū)建設、環(huán)境保護事業(yè)發(fā)展。
對自然保護區(qū)、特殊生態(tài)保護區(qū)的投入，則區(qū)分國家級與自治區(qū)級的不同，分別積極向國家及本區(qū)財政爭取。這么做的目的在于，“切實改變批而不建、建而不管的現存傾向”。
除了加大政府投入，自治區(qū)政府正在考慮，推進污染治理、環(huán)境基建與運營的市場化。
制定推進污染治理的優(yōu)惠政策，充分運用財政貼息、投資補助、收取污染物處理費等手段，吸引社會資金、投資環(huán)保事業(yè)。
與此同時，城市污水、垃圾處理的收費標準將提高。建立鼓勵使用污染處理再生水的價格激勵機制，鼓勵專業(yè)化集中治污和污染治理產業(yè)化。
另外，根據受益者付費、破壞者補償、開發(fā)者補償等原則，自治區(qū)政府將加快建立生態(tài)補償機制。構建遺傳資源惠益共享的機制。根據這個政策，今后礦產資源的開發(fā)，將被征收生態(tài)補償費。
根據政府提供的資料，在過去十年中，內蒙環(huán)保系統(tǒng)擴軍近一倍。
1995年，全區(qū)環(huán)保職員共有2113人。到2004年底，總人數達到3883人。目前，全區(qū)的12個盟市，都已設立了正處級環(huán)境保護局。
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