從2005年5月至今，短短17個月，曾困擾資本市場多年的股權分置改革已經收官在即。據統計，目前兩市S股公司中，還未啟動股改程序的上市公司還有159家(包括15家股改方案未通過的公司)。隨著股改進入收尾階段，股改的難度也明顯加大，不僅各批次股改公司數量稀少，啟動股改公司的股改方案也常常“難產”。從股改的難點來看，主要可以分為七大類。

　　大股東占款待清償

　　在股改的各大難題中，大股東占款問題首當其沖。深滬交易所發布的最新清欠公告顯示，截至2006年10月31日兩市還有100家公司仍存在資金占用問題，其中80家都是未股改公司，占到了目前股改“釘子戶”的一半以上。其中，僅S三九一家，大股東占款金額就達到37.41億元。此外，占款金額較大的還有，S�漇T托普(8.17億元)、S�漇T科龍(5.36億元)、S�漇T重實(5.07億元)、S�漇T三農(5.02億元)，對于這些公司來說，大股東解決或承諾解決欠款問題無疑將成為啟動股改的一個先決條件。

　　重組進程影響股改

　　統計顯示，在目前的159家待股改公司中，有80家為ST、�漇T公司，對于這些徘徊在生死線上的公司來說，依靠現有業務脫貧解困似乎并不現實，擺在他們面前的只剩下重組這一條路。

　　S�漇T金荔三季報就明確表示，公司的股改將取決于公司的重組，年內如果公司的重組成功，股改將同步進行；S�漇T聯誼也表示，公司計劃股改與重組相結合，預計年底之前完成；S�漇T數碼三季報也指出，本公司擬結合重組啟動股改，重組意向確定時可同時啟動股改。數據顯示，在三季報中有近一半未股改上市公司做出了類似的表述。

　　大股東整合影響股改

　　除自身重組因素外，大股東的整合計劃也成為一些上市公司無法啟動股改的原因。

　　中石化系公司

　　股權歸屬成障礙

　　值得注意的是，即使是一些重組已取得重大進展的公司，也因股權歸屬問題未能明確，仍然徘徊在股改大門之外，這中間，S�漇T屯河最具代表性。

　　早在2005年6月，中糧集團就與華融公司簽訂協議�熓茏屍渫泄茉�德隆系4企業所持S�漇T屯河法人股，并著手重組屯河。此后的一年間，中糧集團為S�漇T屯河還清14億元銀行債務，加上注入的資金，共計為S�漇T屯河注資約21億元。

　　不料，正當重組按計劃推進時，卻傳來S�漇T屯河股權因被銀行質押及被法院凍結，無法過戶給中糧集團的消息，這種股權不明晰的狀況不僅嚴重阻礙了S�漇T屯河的股改進程，甚至再度將公司推到退市的邊緣。

　　統計顯示，在三季報中明確提出因股改凍結、質押、訴訟、股權轉讓手續等問題，無法進行股改的還有S�漇T望春花、S�漇T新太、S�漇T朝華、S石紙、S開開、S蘭鋁、S�漇T一投、S綿高新、S藏藥業等多家公司。

　　外資持股限制多

　　從某種程度上說，外資股東是把“雙刃劍”，既能造成二級市場的重大利好，也能造成巨大的利空懸念，后一點在股改中尤為明顯。在目前尚未股改的公司中，就有不少是因為這一原因暫時受阻的。

　　鬧得沸沸揚揚的凱雷徐工并購案就是外資問題阻擾股改步伐的典型。去年10月，凱雷集團欲以3.75億美元的價格收購徐工機械85%股份。然而，外資并購威脅國家經濟安全的大討論逐日升溫，徐工并購案幾經波折，令公司股改不斷推后。此外，深發展股改的一度受挫，在一定程度上也是因為外資大股東的特殊原因。