S*ST新太因被新太新公司挪用資金、違規擔保等而出現巨虧，經營一度陷入困境。S*ST新太原董事長鄧龍龍未經董事會或股東大會審議，擅自以上市公司名義為大股東及其關聯公司提供擔保及直接從S*ST新太占用資金，造成公司大量資金被大股東及其關聯公司以非經營方式占用，截至2006年底共占用公司資金37612.40萬元。

　　由于資不抵債，新太集團所持有S*ST新太的股權幾次被公開拍賣，第二大股東遼漁集團也在尋求出讓其持有的S*ST新太的股份。S*ST新太公布的2007年第三季報中披露，大股東新太新公司及其關聯公司占用公司資金一直沒有清償，另外，2006年1月，公司聯合第二大股東遼漁集團共同向法院申請大股東破產還債，法院駁回后，2006年9月遼漁集團再次向法院申請大股東破產還債，但再次被駁回。

　　2007年10月31日，S*ST新太公告披露，公司已收到法院刑事判決書，董事長鄧龍龍挪用公司資金，被判處有期徒刑六年。但受其拖累的S*ST新太目前仍未走出困境。