一審判決后，李當庭表示不服，提起上訴。2004年3月29日，喻華峰亦提起上訴。

　　就在喻、李二人一審判決宣布前幾小時，2004年3月19日，《南方都市報》原執行總編輯程益中在差旅途中，被廣州市公安局以“涉嫌貪污罪和私分國有資產罪”為名刑事拘留。當年4月1日，程益中被廣州市檢察院以涉嫌貪污罪、私分國有資產罪正式逮捕。

　　“南都案”引起全國范圍的高度關注，在國內法學界和經濟學界引起爭議，被視為關乎如何評價報業改革、國企改革中相關分配制度的典型案件。

　　據《財經》記者了解， “南都案”之所以廣受關注，其中一個關鍵，在于法院一審認定喻華峰犯貪污罪引起較大爭議。法院定罪的主要依據，是認定喻貪污的10萬元“性質上是《南方都市報》職工獎金的一部分，屬于公共財產”，并且在分配上違反了財務管理規定。而這種認定，正觸及了當前國企改革中的焦點話題。

　　對于法院對上述10萬元系公共財產的定性，喻華峰的上訴書未予否認，但認為關鍵是這筆財產的分配權是否在《南方都市報》編委會。根據判決書認定的證人證言，以及《南方都市報》上級主管部門《南方日報》報業集團出具的證明，均證實《南方都市報》編委會擁有分配權。

　　2004年4月中旬，前廣東省委第一書記任仲夷、前省委書記吳南生，就“南都案”聯名向中共中央政治局委員、時任廣東省委書記張德江寫信，要求慎重和寬容處理“南都案”。正在外埠考察的張德江收信后，當即作出了批示。

　　2004年6月15日，廣州市中級法院對喻、李案作出終審判決，確認了一審的定罪，但對量刑略有減輕，對喻華峰的量刑從有期徒刑12年改判為八年；對李民英從有期徒刑11年改判為六年。

　　2004年8月5日，東山區檢察院以證據不足為由，對同案因涉嫌貪污罪而被捕的《南方都市報》原副主編兼財務主管鄧海燕，下達了不起訴決定書，鄧于當日獲釋。

　　2004年8月27日，廣州市東山區檢察院同樣以證據不足為由，對《南方都市報》原執行總編輯、《新京報》原總編輯程益中下達不起訴決定書。當晚，因涉嫌貪污罪名被關押了五個多月的程益中獲釋。

　　《財經》記者獲悉，2007年2月12日，李民英已得減刑提前獲釋出獄。作為《南方都市報》創辦人之一，年逾六旬的李民英如今已退休在家。

　　而隨著喻華峰于2008年2月8日出獄，所有牽涉“南都案”的人員均已獲得自由。

　　喻華峰的友人告訴《財經》記者，喻在四年監禁中并不委靡，而是大量閱讀人文類書籍，學習英語，并擔任《番禺監獄報》責任主編。不久前，在獲知出獄確切日期后，喻表示：“我現在最渴望的是工作。但我不會放棄在法律途徑內尋求對案件的重新審理，我會繼續申訴。”-