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生物發電是一種新生事物，在努力建設循環型社會的日本有著無限的生命力。日本每年家畜排泄物為9100萬噸，食品廢棄物為2000萬噸，給環境帶來沉重的負擔，根據有關法律到2004年月11月家畜排泄物禁止露天堆放，根據《食品循環法》，到2006年排出生鮮垃圾的單位要減排20％，同時對排出的垃圾有義務進行循環利用，于是生物發電在日本俏然興起。
2003年4月，日本巖手縣葛卷町第一座牛糞便發電廠開始運轉。該町有300家奶牛專業戶，飼養奶牛1萬頭，散居在435平方公里內。第一座發電廠利用200頭牛的糞便發電，發電廠建在畜產基地內，建設費用約為2.2億日元，葛卷町還計劃利用牛糞便制造燃料電池。牛糞發電在北海道地區很受歡迎，目前有很多地方都在考慮用牛糞發電，以解決露天堆積，污染環境的問題。
隨著日本越來越追求食品新鮮度，食品垃圾日益增多，過去多用焚燒的辦法處理，由于食品多含有水分，焚燒時要用重油，浪費能源不說，還容易產生二惡英，嚴重污染環境。為了解決這一問題，近來日本開始用食品垃圾發電，東京都江戶區部分企業2003年開始回收商場和飯店的食品垃圾，用發酵后生成的沼氣發電，一些企業設置了食品垃圾箱，將垃圾粉碎混合成液體，用密封車回收。經過一個月的發酵后提取出含60％沼氣的氣體，用于燃燒發電。發出的電力除供參與回收食品垃圾的企業外，還可供給附近居民。
用食品垃圾發電東京還有更大的舉措，這就是到2005年秋天要建成國內最大生鮮垃圾發電廠。大型企業市川環境工程等3家公司出資在東京大田區城南島興建的大型生鮮垃圾發電廠，從4月開始動工，建成以后，回收殘羹剩飯和賣不出去的盒飯，發酵之后變為沼氣，制成燃料電池。設計垃圾處理能力每天為110噸，相當于73萬人排出的生鮮垃圾量，可供2420戶用電，2/3供東京電力公司出售，1/3供三家出資公司的工廠使用。現在生鮮垃圾再利用多制成食餌和肥料，但混入筷子等異物超過2％，就很難再利用，用生鮮垃圾發電即使混入10％的異物也沒有問題，因此，飲食業能夠充分利用。
日常生活中從每個家庭中會排出很多生活垃圾，日本國土交通省從2003年開始實施垃圾發電計劃，利用垃圾中的菜葉和污水處理廠的沉淀物混合發酵生出的沼氣作為渦輪發電機的燃料。這項計劃實施起來取材比較容易，除菜葉之外，樹木枝葉、糞尿也可用來發電。污水沉淀物提取沼氣以后，還可以做為農家肥使用。在計劃實施過程中，設在污水處理廠內的發電設備將由日本國土交通省負責提供。具有12萬人生活污水處理能力的污水處理廠每天的沉淀物與同樣多的菜葉混在一起發酵，生成的沼氣用來發電，發電量可基本滿足兩萬家庭的需求。
生物發電把垃圾變廢為寶，又可以解決垃圾堆放占居空間和污染環境的問題，可謂是一舉兩得。
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