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正在公開征求意見的《關于首次公開發行股票試行詢價制度若干問題的通知》(征求意見稿)將徹底引變機構投資者參與一級市場的方式，機構投資者參與新股申購的風險大大增加。
基金經理們對新的詢價制的第一反應是：增加了參與一級市場的難度，也增加了基金的風險。過去的IPO定價有固定市盈率規定，現在完全要靠機構投資者自己
的定價能力，誰定得準，誰的贏面就大。在過去，由于定價機制的原因，申購新股肯定賺錢，新股上市后一般都溢價，基金不用考慮買誰不買誰，甚至都不用考慮多買還是少買。詢價制實施后，基金必須對每只新股進行全面的定價分析，是否申購、在什么價位上申購、申購多少金額都是基金必須評估的。
不僅如此，由于“詢價對象應承諾將獲配股票鎖定3個月以上，鎖定期自向社會公眾投資者公開發行的股票上市之日起計算”的規定，基金等機構投資者必須對新股上市后三個月后的走勢進行預測評估，各項宏觀經濟政策、資本市場的政策以及市場變化都會影響股價，增加了基金的風險。
對于詢價制帶來機構投資者參與一級市場難度和風險增加，業內人士認為，這是很正常的。詢價制改變了過去固定發行市盈率定價、上市后肯定溢價的老模式，過去參與一級市場象是抽獎而不是投資。這種風險和難度的增加是應該的，是與國際接軌的表現。
不過，機構投資者對詢價制也有一些疑慮。如，有基金表示，《通知》征求意見稿規定“公開發行數量在4億股以下的，配售數量應不超過本次發行總量的20%；公開發行數量在4億股以上(含4億股)的，配售數量應不超過本次發行總量的50%。”只對配售數量的上限作了規定，而未對配售數量的下限進行規定。目前機構參與新股申購要么參加網下配售，要么是網上市值配售，兩者只能任選其一，他們擔心，碰上一些質地優良的公司，投行可能只拿很少一部分來進行配售，這樣，機構投資者不僅可能失去投資一級市場的機會，而且IPO價格可能會偏高。
另一方面，也有機構擔心新股的流通性問題。因為總體而言，國內基金、券商和QFII的數量不多，參與主體不夠多，20%-50%的流通股都集中他們手中，可能帶來流通性不夠的問題。
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