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1999年6月5日國務院對國家科技部和北京市政府的《關于實施科教興國戰略加快建設中關村科技園區的請示》進行了正式批復(即《國務院關于建設中關村科技園區有關問題的批復》)，這標志著中關村科技園區進入了一個全新的發展階段。隨后，原“北京市新技術產業開發試驗區管理委員會”正式更名為“中關村科技園區管理委員會”。
目前中關村科技園區已形成“一區五園”的發展格局，包括海淀園、豐臺園、昌平園
、電子城科技園和亦莊科技園。作為中央編辦和國家科委確定的《全國開發區行政管理體制和機構改革》試點單位和市政府派出機構，中關村科技園區管委會經市政府授權，具有市級經濟管理權。中關村科技園區實行市區兩級管理體制。管委會實行委員制，委員由市管委會、市政府有關部門和區縣有關領導組成。
北京市副市長、建設中關村科技園區領導小組辦公室主任劉志華任市管委會主任，海淀區區長李進山任第一副主任，建設中關村科技園區領導小組辦公室副主任陸昊任常務副主任、黨組書記，馬林、任冉齊、張貴林、夏穎奇任副主任，趙慕蘭任專職委員，園區負責人洪啟忠、楊義春、鮑玉桐、王金玲等同志兼任市管委會副主任。
管委會常務副主任
中關村科技園區建設指導思想是：以江總書記講話為指針，全面貫徹國務院《批復》精神；把握知識經濟特征，遵循市場經濟規律建設園區；堅持以人為本、以企業為中心；實施小政府、大社會的管理體制；充分利用首都豐富智力資源，發揮高等院校、科研院所和高科技企業的整體優勢，加強技術創新，加速成果轉化，實現產業化。
中關村科技園區建設工作思路是：政府在構建有利于技術創新和產業發展的硬環境、軟環境和思想文化氛圍三個層面上全面推進工作。同時在計劃經濟向市場經濟轉軌過程中，政府確有必要親自整合區域創新資源，推進重要產業化項目發展和產業基地建設。
在硬環境建設方面，要通過標本兼治整治園區外部環境，加強基礎設施建設，創造出適合高科技人才生活、工作的人居環境和高科技產業發展的科研、生產基地。
在軟環境建設方面，要先在技術層面的人力資源、創業孵化、中介與社會服務、資本市場等四個體系上采取改革措施，并在制度層面的政府行為、政策體系及法律體系上實現突破，推動能有效促進區域高新技術產業發展所必需的機制和體制創新。
在思想文化氛圍方面，要高度重視思想文化背景對經濟發展的一般作用，牢牢把握什么樣的思想文化背景對區域高新技術產業發展具有促進或阻礙作用，并努力營造與高新技術產業發展相吻合的思想文化氛圍。
2001年8月
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