作為曲阜市集文物收藏、研究和展覽為一體的綜合性博物館——孔府文物檔案館，其館藏文物十分豐富，字畫一項總計6500件，主要為孔府舊藏。

　　孔府舊藏的花鳥畫作品雖不能與北京故宮所藏的花鳥畫作品相媲美，但因孔府的特殊地位，亦不乏珍品。有些為朝廷賞賜，比如慈禧賞賜彭氏婆媳二人的《松鶴圖》，有些為友人贈送。其中清鄭板橋為孔府特畫的《竹蘭圖》、慈禧繪賜《松鶴圖》是孔府珍藏的瑰寶。引人注目的還有孔子七十四代孫衍圣公孔繁灝的繼配夫人畢景桓繪的《蝴蝶冊》16幅和《花籃冊》12幅，所繪100余種蝴蝶，個個色彩鮮艷，婀娜多姿，晶翅透明，宛如真蝶。其中主要的作品有：

　　鄭板橋《竹蘭圖》：紙本水墨，縱138厘米，橫70厘米。圖繪墨竹、蘭草、靈芝3盆。款“癸酉九秋板橋鄭燮”，朱文印2方：“濰夷長”、“橫掃”，并有長篇題跋，敘述作畫原由。此圖作于清乾隆十八年，所繪蘭、竹寥寥數筆，勁秀挺拔，疏宕灑脫。鄭板橋善畫蘭、竹、石，尤精墨竹，承襲徐渭、石濤、八大山人之技法，擅長水墨寫意。他筆下的竹、蘭，挺勁弧直、歆幽雅香，具有一種剛正、弧傲的性格，表現出“倔強不馴之氣”，這就是自己理想和人品的化身。在藝術手法上，鄭板橋主張“意在筆先”，用墨干淡并兼，筆法疲勁挺拔，布局疏密相間，以少勝多，具有“清癯雅脫”的意趣。他還重視詩、書、畫三者的結合，用詩文點題，將書法題識穿插融匯于畫面之中，形成完整、和諧的統一體。畫竹是“以書之關，紐透入于畫”。畫蘭是“借草書中之中豎，長撇運之”，進一步發展了中國特有文人畫的特點。此幅墨竹、蘭草、靈芝三聚，內涵豐富，寓意深遠，是一難得的藝術珍品。

　　《松鶴圖》：紙本，畫面縱115厘米，橫55厘米，畫面磁青地，泥金繪。畫右下繪古松一株，左上繪一仙鶴空中飛翔。右上題“光緒甲午季秋下浣御筆”，鈐“大雅齋”、“鏡榮燭和”、“永壽樂愷”印。正上方為“慈禧皇太后之寶”方印。左下題七言詩一首：“九皋聲遠和鳴時，一幅高秋畫入詩。最是朝陽渲染處，金光飛上萬年枝。”為王懿榮所題。這幅《松鶴圖》是衍圣公孔令貽奉母挈妻進京，朝貢慈禧六十大壽時所賜。松、鶴是傳統繪畫中常見的吉祥題材之一，寓祥瑞長壽之意。此畫清新高雅，意境深遠，寓意明確，既表現出我國傳統文化的內涵，又反映了孔氏家族與清廷特殊的政治關系。

　　《畢景桓花卉冊》：紙本設色，縱31.3厘米，橫39厘米，分《蝴蝶冊》16幅和《花籃冊》12幅，被綾裱1冊，內容為各色蝴蝶、花籃。首頁題：“此冊并蝴蝶冊皆畢太夫人所繪，花籃共十二，各有不同彩色，百余年猶如新，足見筆力皆過于紙背，非平人所能及也。曾孫德成敬記。”冊頁可見朱文印多方，有“畢”、“景桓”、“畢景桓印”、“象花寫照”、“少英女史”、“少英”、“繡余生活”等。此冊頁工筆重彩，筆力柔媚，設色鮮明，寫實逼真。從題記中可以看出此畫冊在孔氏家族中的影響和地位。