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上海農工商集團積極與國內外企業、科研單位合資合作，組織“產學研”聯盟，開展科技攻關，推進社會主義新郊區、新農村建設。
光明乳業、光明荷斯坦牧業和杰隆生物公司合作開展的市科教興市重大產業科技攻關項目《優質奶牛肉牛育種項目》，已取得階段性成果；上海市奶牛育種中心已形成200頭種公牛規模，成為全國優秀公牛種質重要生產基地，凍精和胚胎的產銷量與銷售額居全國前茅
；上海奶牛育種中心的DHI測試系統控制的牛頭數已達6萬頭；開發的HERP牧業資源管理信息系統，對動態監控牧場全程生產，使母牛群育種信息的采集更為科學；開展的性別控制技術研究，可從妊娠6個月以上的母牛血液中檢測出其SRY基因；2008年，上海奶牛育種中心將建成國內最大的DHI測試網絡和最大的奶牛、肉牛種質資源庫，種奶牛場的規模、生產水平將居國內第一、亞洲一流。上海鮮花港與荷蘭、以色列、德國等政府及多家花卉生產企業共同開展現代園藝技術開發與生產合作，經美國農業部檢疫檢驗局官員的實地檢測后，成為國內唯一取得向美國直接出口花卉種苗的企業，目前正在作進入歐盟的質量認證工作。上海鮮花港企業發展有限公司與專家合作承擔市重大產業科技攻關項目《花卉種源和產業發展關鍵技術創新》， 開展對國內外野生花卉的種質資源收集、轉育和引進品種的二次創新等研究，建立現代化的種質資源庫，《非洲菊的收集、保存與繁育》等研究已通過科技成果鑒定，達到國內領先水平。
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