2003年2月20日，國土資源部召開全國電視電話會議，部署治理整頓土地市場秩序。1999年以來，有關部門至少組織了三次全國土地市場治理整頓工作，但是，治理整頓依舊阻擋不住各地洶涌的“圈地風潮”。

　　7月31日，溫家寶總理在一次土地整頓電話會議上強調，土地是民生之本。此前，他曾經批示：一些地方土地市場秩序混亂，非法占地、非法入市的問題相當嚴重，利用土地牟取 暴利已經成為一些單位和個人“尋租”的手段。

　　8月8日，奉國務院領導指示，國土資源部、國家發(fā)改委、監(jiān)察部、建設部、審計署五部委組成10個聯合督察組，對各地土地市場秩序治理整頓情況進行明察暗訪。

　　9月17日，國土資源部下發(fā)關于“嚴格控制高檔商品住房用地、停止申請報批別墅用地”通知。

　　9至10月間，聯合督察組帶回的信息觸目驚心，各地擅自批準設立各類開發(fā)區(qū)，隨意圈占耕地和違法出讓、轉讓土地，擅自出臺優(yōu)惠政策導致開發(fā)區(qū)過多過濫。督察組的匯報引起高層強烈關注。其間，中國一些大中城市的糧價發(fā)生了近年來罕見的波動，分析者認為，糧價上漲與耕地減少有著密切關系。同時，土地市場的混亂也直接影響了國民經濟的健康運行，造成了巨大的金融隱患。

　　溫家寶總理再次作出嚴厲批示。

　　10月28日，全國人大常委會經過表決，決定免去田鳳山的國土資源部部長職務。田鳳山因有嚴重違紀問題，此前已被雙規(guī)。

　　11月3日，國務院發(fā)出《關于加大工作力度進一步治理整頓土地市場秩序的緊急通知》。

　　11月16日，國土資源部公開宣布將調查5起土地違規(guī)大案。有關負責人強調，這次公開調查的5起案件如果情況屬實，將公開處罰，公開追究責任。國土資源部此舉未事先通知地方政府，措辭之嚴厲為歷來罕見。隨即，調查組奔赴五地，引起了各地極大震動。

　　11月22日，國務院發(fā)出通知，要求進一步加大治理整頓土地市場秩序工作力度。通知不點名地批評了一些現象：一些地方主要領導對治理整頓工作重視不夠，處于等待和觀望狀態(tài)；開發(fā)區(qū)清理整頓還停留在摸清底數和查找問題階段，處理工作尚未全面開展；征地補償不落實，農民失地失業(yè)的問題還沒有解決；有些地方清理整頓措施不落實，頂風違法行為仍有發(fā)生。通知稱，“要堅決嚴肅處理，決不姑息”。

　　11月28日，國土資源部召開新聞發(fā)布會，通報全國土地市場秩序治理整頓工作進展情況。國土資源部10月受理的來信來訪量比9月明顯下降，來信總量下降15.5%，來訪人次減少48.9%，其中集體訪人次減少了63.4%。

　　12月2日，國土資源部再發(fā)禁令：對不符合國家產業(yè)政策的項目、不切實際的“形象工程”及“政績工程”項目、別墅項目、高爾夫項目，一律不報批用地。三個月內，連發(fā)兩道內容相似的禁令，足見高層的決心以及各地問題的嚴重。

　　12月21日，國土資源部執(zhí)法監(jiān)察局再次公布了4起違法用地大案。這4起案件均發(fā)生在2003年，最近的一起發(fā)生于2003年10月。國土資源部特別強調，這些地方是“頂風違法”。

　　12月27日至28日，全國國土資源廳局長會議在北京召開。國土資源部部長孫文盛強調，“影響國土資源保護和合理利用的障礙因素不少，執(zhí)法監(jiān)督難的問題仍然很突出”，“一些地方國土資源管理松弛、執(zhí)法不嚴，有的干部存在‘好人主義’、庸俗作風、軟弱渙散等問題，甚至為不法分子大開方便之門”。

　　這次會議宣布，中央政府已決定在全國實行省以下土地垂直管理體制。省以下各級地方政府不再管理國土資源部門，保證對土地實施更為有效的監(jiān)管。

　　截至2003年12月底，國土資源部共清查各類開發(fā)區(qū)6015個，這些開發(fā)區(qū)規(guī)劃面積達3.54萬平方公里，超過了現有城鎮(zhèn)建設用地總量。據十個省(區(qū)市)的統(tǒng)計，在458.1萬畝園區(qū)實際用地中，未經依法批準的用地占68.7%。

　　同時，中國的耕地面積正在以驚人的幅度減少。1999年，全國耕地面積減少650多萬畝，2000年減少近1500萬畝……到了2002年，這個數字已經變成2500多萬畝。

　　分析者警告，耕地的連年減少已經威脅中國的糧食安全。