主從關系影響到部門之間的利益分配格局。電力工業部和水利部合并成新的水利電力部。著名的傅作義將軍由原來的水利部長變為了水電部長。而陳望祥也隨同他工作的計劃司一道進入了水利電力部，參加水電的規劃工作。

　　年輕、敢說敢言、喜歡獨立思考的陳望祥在新的司里沒有待多久。也就在這一年，他被打成“右派”，逐出京城，下放到設在貴州的水利電力工程局，參加貓跳河水電工程。這一“沉”，就是20年。

　　80年代：能源委曾經鼎盛

　　直到1978年，人到中年的陳望祥才被解放。這年年底，水利電力部部長簽字同意他回京工作，等他接到通知，過完春節，于1979年2月回京報到時，卻發現短短一個來月，水利電力部“沒了”，被重新分拆為了電力部和水利部。

　　陳便回到電力部計劃司上班。這時他才知道，是他50年代在燃料工業部時的老領導劉瀾波提議把水利電力部分拆。

　　此時，1955年撤銷燃料部所造成的中國能源分治格局已持續了25年。經過十年文革動亂，電、油、煤都很缺乏，中央深感加強能源為當務之急。通過綜合管理來加強能源領域的領導的新體制實驗在形勢所迫下開始。

　　1980年，國家能源委員會成立。委員會主任由傳奇的獨臂將軍余秋里擔任。作為五六十年代的石油部長、領導大慶油田創業，“把貧油帽子扔進太平洋”的元勛，當時的國務院副總理余秋里是能源管理中的強勢領導人，當時的國家能委里，石油部、煤炭部和水利電力部的部長都是他的副手。

　　因此，在陳望祥看來，從領導力量來說，1980年是實現能源部門整合條件最好的時候。當時的國家能委從電力部、石油部、煤炭部抽調了大批精干人員來工作，陣容堪稱鼎盛。

　　但僅僅兩年后，1984年，國家能委被取消。

　　“取消的最重要原因是能委在權責定位上和國家計委存在嚴重沖突。”陳望祥介紹說，

　　有“經濟內閣”之稱的國家計委是計劃經濟時代最重要的政府部門，全國經濟管理中的大部分權力，包括項目批準、價格管理等都在計委，能委沒什么權。

　　與此同時，能委下面的水利部、電力部、石油部和煤炭工業部，本身就是政企不分，“很難管，有什么事都直接找總理，不找能委。能委被架空。”

　　在能委被取消前，面對在水電開發中吵架不斷的水利部和電力部，國務院再次做出合并的決定。1982年3月，水利電力部再次成立，部長為錢正英，李鵬為第一副部長。

　　盡管能源領域統一管理的試驗遭遇失敗，但在改革開放后能源短缺的現實壓力下，能源領域的市場化體制變革開始萌芽。1985年，國務院提出政企分開，電力工業部、水利工業部、煤炭工業部都開始向建立總公司的方向發展。這為再次成立綜合的能源管理部門提供了新的可能。

　　90年代：空殼能源部

　　1988年5月，根據七屆全國人大常委會原則批準的國務院機構改革方案，能源部正式成立，黃毅誠任部長。